作者：汪晶晶 

儀器簡介 

Zeiss全自動數字玻片掃描系統Axio Scan. Z1具有全自動明場、熒光和偏振光掃描等成像功能，可幫助研究人員對固定組織切片和細胞樣本進行大批量、全組織、全自動的高速掃描，并可進行Z軸層掃和景深拓展計算。其“托盤”設計可實現一次性掃描100張玻片，環形光闌照明方式（Ring Aperture Contrast）可確保對熒光樣本提供最大限度的保護。
本期主要介紹明場掃描profile的基本設置、保存與選用。

1. 明場（Bright field）profile基本設置 

1.1 選擇樣品的拍攝方式（profile） 

明場拍攝默認profile主要有Default_BF_10X、Default_BF_20X、Default_BF_40X，通常情況下，選擇Default_BF_10X、Default_BF_20X即可。下面以Default_BF_10X拍攝方式為例進行設置說明。 

關閉Axio Scan.Z1的拱門后，將出現如下界面：在左側下拉菜單中選擇“Default_BF_10X”,單擊樣品預覽區上方的“unmark all”取消所有樣品的勾選，只勾選一張需要進行參數設置的樣品即可，進行后續操作。

1.2 樣品預覽（preview） 

樣品勾選完成后，點擊左側“Start Preview Scan”，掃描儀將讀取樣品信息。

已完成掃描預覽的樣品，將顯示“preview done”的狀態（如下圖樣品1）；正在掃描的樣品顯示“creating preview”(下圖樣品2)；未進行掃描預覽的樣品顯示“new”（下圖樣品3）。

1.3 明場掃描設置界面 

樣品預覽完成后，點擊樣品預覽區中下的“Open advanced wizard”（紅色方框2）進行各項參數設置。

注意：步驟1中的profile（上圖左紅色方框1）中以“Default”為首命名的均為已設定好的默認方案，請用戶不要擅自修改！  

1.3.1 Global data 

此步驟為系統已設定好的默認參數，可直接進行下一步操作。

1.3.2 Label Scan Settings 

此界面可以設置標簽區域的拍攝參數。一般情況下這些參數均無需修改，為默認最佳設置參數。如需修改標簽圖成像方向，可在“Label Orientation”下單列表中選擇旋轉角度，用戶可隨意拉動方框邊緣調整到合適的標簽圖像采集區域。

1.3.3 Preview Scan Settings 

此界面可以設置預覽相機的拍攝參數。一般情況下為系統默認的最佳設置，用戶也可以根據實際情況手動調節曝光時間（Exposure time）以及樣品拍攝區域（下右圖紅色方框）。 

注意：此步修改紅框的位置后，樣品需重新進行預覽。

1.3.4 Tissue Detection Settings 

此界面中綠色方框圈選的區域代表用戶的感興趣區域（ROI），只有在ROI中的區域才會被掃描。使用“test”按鈕，軟件將自動圈選出被檢測到的樣品（綠色邊界內）。

1.3.5 Scan Settings 

在導航窗口（Navigation）點擊玻片的干凈空白處，點擊界面左側的“Measure and White Balance”調節白平衡，單擊“finish”退出profile設置界面。 

說明：白平衡調節一次即可，若感覺樣品預覽區對比度良好，可不進行此步操作。 

1.3.6 Start Scan 

點擊頁面左側“Start scan”按鈕，開始掃描。

2. 新建profile的保存與選用 

2.1 新建“profile”的保存 

設置好profile后，如需要保存，請點擊下圖所示的“Save adapted scan profile”，在彈出的“Save As”對話框中以“PI’s name-your name-修改的默認profile”格式命名，點擊“Save”。 

2.2 新建“profile”的選用 

一般情況下，剛剛保存的profile會在左側profile列表的最下方找到，要應用此profile時，“Scan Status”的狀態需顯示為“new”，用戶也可以選中需要修改的樣品，單擊右鍵，將掃描狀態切換為“Resent Scan status to new”后，在左側調用profile。