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                3D掃描Pro--多點時間三維序列采集
                2018/11/125339

                作者:曹慧珍 

                很多時候,Z-序列需要和多點或時間序列連用,但這時會遇到很多問題! 

                我們想象中樣品是整齊的排列在小皿里 

                直接設定Top、Bottom、Step,ND窗口中勾選Z、XY、T,Run Now開始采集圖像就好啦。 

                但是樣品通常長這樣: 

                樣品在小皿上的高度并不相同,如果直接設定Top、Bottom,采集的厚度將會翻倍,浪費大量時間。 

                另一種Z軸范圍選定方法就發揮作用了 

                1、ND Acquisition窗口XY選項卡下記錄樣品的XYZ信息(Z需要是3D stack的中間面); 

                2、ND Acquisition窗口Z選項卡下勾選黃色漏斗狀圖標; 

                3、設定樣品step和總厚度; 

                4、點擊run now開始采集圖像序列。 

                樣品的總厚度和每個點的中間焦面可通過設定top和Bottom的方法獲得,立方體中間的數值即中間面。 

                這種方法工作原理:先到達記錄的XYZ位置,根據中間面Z計算出三維序列的起始面,開始采集三維序列,然后到達另一個XYZ位置,計算出新的Z軸起始面,采集另一個三維序列,循環往復。 

                還有的樣品更任性: 

                樣品不止在小皿上的高度不同,它們自己的厚度也相差很大,這時候用上面的方法拍,range需要由最厚的樣品決定,比較浪費時間, 

                NIS-element有終極武器ND Sequence Acquisition 

                1、鼠標右擊軟件上的空白部分,從彈出的菜單中選擇[Acquisition Controls] -> [ND Sequence Acquisition]以調出對話框。 

                2、點擊add添加一個ND程序,新彈出一個類似ND Acquisition的窗口 

                3、XY選項卡下記錄位置信息,Z選項卡下按照top、bottom的方法或找中間面的方法設定Z軸掃描范圍; 

                4、點擊OK; 

                5、回到ND Sequence Acquisition主窗口,add添加另外的ND程序,多次重復此步驟; 

                6、勾選[Time lapse]設定時間序列; 

                7、run now啟動程序。 

                有過細胞timelapse拍攝經驗的小伙伴都知道,細胞會發生熱漂移現象,必須打開PFS系統才能實現長時間的拍攝,XY選項卡下記錄每個點的鎖焦面,以該面作為relative去采集多點三維時間序列,然而細胞往往是貼壁的,鎖焦面通常是細胞中信號最為清晰的焦面,而非中間面。 

                這個時候我們可以選擇另一種方式設定Z軸掃描范圍,先調焦確定最清晰的焦面(鎖焦面)和top/bottom之間的距離,然后打開PFS,XY選項卡下記錄位置焦面高度信息,Z選項卡下,分別設定向上向下掃描厚度,然后設定step,開始ND程序采集。 

                XY-Z-T程序略復雜,大家有需求可以預約輔助實驗哦! 

                本文章版權歸清華大學生物醫學測試中心尼康影像中心所有

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